热血足球3对战游戏里只能选择6个球队(热血FC与5强豪),1P与2P可以选择完全相同的球队进行对战。
对战模式的等候室画面设定与热血FC模式大体相同,只是少了若干选项,例如『みーてぃんぐ(Meeting)』会面。
对战模式里:2P意味着1P玩家与2P玩家对战。3P意味着1P玩家与2P玩家对战,3P玩家操作1P球队的门将。4P意味着1P与3P合力对战2P与4P,3P与4P分别操作1P与2P球队的门将。